根据《国家口岸管理办公室关于2020年12月及全年全国和各省（区、市）整体通关时间情况的通报》，2020年，云南省口岸进口整体通关时间为14.02小时，比全国平均进口通关时间少27.8小时，较2017年压缩87.56%，排全国进口整体通关时间最短省区第4位；云南省口岸出口整体通关时间0.12小时，比全国平均出口通关时间少2.07小时，较2017年压缩89.4%，出口整体通关时间排全国最短省区第1位。

2020年，在省应对新型冠状病毒感染肺炎疫情工作领导小组指挥部的统一领导下，云南省商务厅（省人民政府口岸办）积极会同昆明海关、云南出入境边防检查总站、省发展改革委、省交通运输厅、省市场监督管理局等单位，坚决贯彻落实党中央、国务院和省委、省政府关于疫情防控的决策部署，统筹做好疫情防控和口岸经济发展工作，在确保口岸疫情防控安全的基础上，密切协调配合，加强联防联控，增加口岸现场工作人员，延长通关时间，对疫情防控物资进口和鲜活农产品实行快速通关“绿色通道”等特殊措施，随到随检随放，快速通关；推进鲜活产品24小时预约通关、无纸化通关，减少人为干预，加快通关效率，缩短通关时间；为未雨绸缪提前应对边境口岸疫情防控措施持续加强和周边国家鲜活农产品集中入境高峰期叠加可能带来的口岸严重拥堵风险隐患，牵头制定《全省口岸疫情防控期间农产品进出口高峰期通关保障工作方案》，制定特殊有效措施，报省应对新型冠状病毒感染肺炎疫情工作领导小组指挥部批注后印发执行；指导和规范口岸收费跨境运输代驾收费工作，对发现的问题及时督促、限时整改；整合精简随附单证，减少重复作业和单证递交环节，推进单证电子化工作，持续推动去繁就简和通关流程再造；认真落实《云南省人民政府关于建立营商环境“红黑榜”制度的通知》要求，牵头海关、边检等口岸部门，优化流程、创新举措，全力推进优化营商环境政策的全面落实，确保政策红利见实效，并对照“红黑榜”自查自纠、认真整改，发挥倒逼改革作用，不断压缩全省整体通关时间，持续优化口岸营商环境。